версия ПО 4 расширенная используется на 16А20ф3с39
на 16К20Т1 бывает 2,3,4
в руководстве МПУ №31описано как определить какая версия на родных платах.
установите правильную версию и внесите родные параметры.
проверьте что установлены родные  датчики для данной версии
 

Версию пробовал менять, станок адекватно работает только на 4 расширенной. Проблема с оборотами на энкодере одинаково остается и на других версиях.

Энкодеры так-же менял, на заведомо рабочие, новые

ввожу на пульте S500. ручку коробки скоростей в диапазон до 1000 оборотов который. на моей стойке МС2109 на станке 16А20 вводить команды диапазонов М39, М41, М42 не надо. станок всё концевиками в ЧПУ сам отсылает.

дальше тахометром, у меня электронный с магнитом замеряю реальные обороты шпинделя и подстроечным резистором многооборотным (если память не изменяет) на плате привода выставляю обороты по тахометру 500.

если память не изменяет, по тахометру 500 оборотов, а на индикаторе 700 показывало  в режиме вывода на индикатор показаний энкодера, или наоборот, забито с пульта S500. я с этим так ничего сделать не смог и смирился.

единственный минус был, 1000 оборотов нельзя было включить. ЧПУ с энкодера видело, что импульсов 1400 и вырубало шпиндель. поэтому больше 700 оборотов не вводил просто. и так на всех диапазонах. 

Где и как в параметрах изменить коэффициент датчика шпинделя по моим прикидкам 1,4 так и не нашёл.

Точнее показания датчика уменьшить надо было . то есть коэффициент 0,7142857142857143 примерно 0,7 ну или хотя бы 0,5.

Энкодер должен быть на конкретное количество меток, то, которое было ранее на станке.
Версия математики должны быть та, которая была ранее.
Тогда все работает без каких либо пересчетов.
Выясните какая версия математики была ранее, когда станок работал.

по моему датчик оборотов шпинделя по умолчанию должен стоять 1024 импульса. Так задумано конструктором ЧПУ. но все его заменяют на 1000 импульсов. это отражается только на шаге резьбы и корректируется изменением параметра 6М. Вопрос в том, как найти параметр, отвечающий за срабатывание защиты при превышении оборотов заданного диапазона. Или добиться того, чтобы количество импульсов с датчика оборотов шпинделя равнялось числу импульсов, которое видит ЧПУ. Хотя при нарезании резьбы ЧПУ нормально воспринимает импульсы с датчика и корректно их интерпретирует, а при слежении за оборотами шпинделя, видит обороты, увеличенные на 1,4 раза. не могу проверить на других версиях ПО и на других станках, но на МС 2109 на диапазоне до 1000 об/мин, больше 700 оборотов выставить не могу, начинает срабатывать защита. в режиме индикации числа оборотов шпинделя при задании S720 на индикаторе будет уже порядка 1000 оборотов. для других диапазонов такая же ситуация с максимальными оборотами сохраняется. станок 16А20